Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 54.84□□□□□ -1.631e-34■□□□□ 9.2
NIPBLQ6KC79 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.051e-34■□□□□ 9.2
NIPBLQ6KC79 ZC3H4-202ENST00000594019 3259 ntTSL 28.87□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 9.2
NIPBLQ6KC79 ZC3H4-205ENST00000601973 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.87□□□□□ -0.992e-7■□□□□ 9.2
NIPBLQ6KC79 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.152e-7■□□□□ 9.2
NIPBLQ6KC79 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-14■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-14■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 TP53BP2-209ENST00000483398 1841 ntTSL 26.52□□□□□ -1.371e-14■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 LRRC14-204ENST00000528528 1408 ntTSL 324.63■■□□□ 1.536e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.016e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-211ENST00000600753 483 ntTSL 419.48■□□□□ 0.716e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.696e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.376e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.316e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.276e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SPPL2B-214ENST00000622308 749 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.156e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.126e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AC011448.1-202ENST00000586674 1071 ntTSL 215.61■□□□□ 0.096e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-208ENST00000597808 570 ntTSL 215.2■□□□□ 0.026e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 DOT1L-202ENST00000446286 376 ntTSL 314.83□□□□□ -0.046e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-205ENST00000594144 723 ntTSL 314.41□□□□□ -0.16e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 214.31□□□□□ -0.126e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.146e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.156e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-207ENST00000526650 457 ntTSL 314.05□□□□□ -0.167e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 213.66□□□□□ -0.226e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SPPL2B-206ENST00000593243 551 ntTSL 413.61□□□□□ -0.236e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 313.19□□□□□ -0.37e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-204ENST00000465313 446 ntTSL 313.13□□□□□ -0.317e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NDUFA13-202ENST00000502506 1166 ntTSL 213.06□□□□□ -0.326e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.387e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.486e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CCDC47-206ENST00000584112 588 ntTSL 211.56□□□□□ -0.566e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 511.5□□□□□ -0.576e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.586e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.586e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.696e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.76e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-206ENST00000594526 709 ntTSL 310.57□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NDUFA13-207ENST00000606722 502 ntTSL 310.55□□□□□ -0.726e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NDUFA13-204ENST00000507754 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.746e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.946e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NCAPG-205ENST00000514176 3017 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.966e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 LRRC14-207ENST00000530242 93 ntTSL 38.57□□□□□ -1.046e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CCDC47-203ENST00000580986 552 ntTSL 48.32□□□□□ -1.086e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SAE1-210ENST00000600706 744 ntTSL 58.26□□□□□ -1.096e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.196e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-201ENST00000319863 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.197e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 GATD1-202ENST00000354286 3973 ntTSL 57.4□□□□□ -1.227e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.386e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.396e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.546e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.666e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-204ENST00000504676 1772 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.676e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.726e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-211ENST00000606826 800 ntTSL 54.3□□□□□ -1.726e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.816e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NCAPG-203ENST00000510063 807 ntTSL 53.48□□□□□ -1.856e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC3.22□□□□□ -1.896e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 ANKRD12-202ENST00000359158 2250 ntTSL 20.69□□□□□ -2.31e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 MAN2A2-206ENST00000558290 1049 ntTSL 516.17■□□□□ 0.181e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 MAN2A2-223ENST00000560534 361 ntTSL 515.16■□□□□ 0.021e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 MAN2A2-210ENST00000558853 624 ntTSL 314.77□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 MAN2A2-218ENST00000559999 529 ntTSL 414.03□□□□□ -0.161e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-205ENST00000546367 560 ntTSL 411.31□□□□□ -0.61e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-218ENST00000552861 2499 ntTSL 29.94□□□□□ -0.821e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-202ENST00000333003 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.431e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 RSL1D1-211ENST00000574287 485 ntTSL 24.96□□□□□ -1.621e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-204ENST00000545833 1305 ntTSL 1 (best)3.17□□□□□ -1.91e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 21.64□□□□□ -2.151e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NR2C1-209ENST00000548252 573 ntTSL 30.24□□□□□ -2.371e-8■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 HIST1H4H-202ENST00000634560 1034 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 HIST1H4H-201ENST00000377727 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.233e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 HIST1H4H-203ENST00000634956 2163 ntTSL 56.66□□□□□ -1.343e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 HSP90B1-208ENST00000551983 728 ntTSL 23.08□□□□□ -1.922e-30■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.432e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC0.63□□□□□ -2.313e-30■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 218.56■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 28.13□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 ARID4B-211ENST00000474953 3463 ntTSL 28.72□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.721e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.971e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.151e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 ATXN2L-219ENST00000566007 471 ntTSL 38.14□□□□□ -1.112e-7■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.32e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.232e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.12e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.382e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.42e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-208ENST00000570801 565 ntTSL 211.79□□□□□ -0.522e-9■□□□□ 9.1
NIPBLQ6KC79 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-9■□□□□ 9.1
Retrieved 100 of 8,528 protein–RNA pairs in 46.6 ms