Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NCAPH2Q6IBW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NCAPH2Q6IBW4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms