Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ANKRD40Q6AI12 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms