Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALS2CLQ60I27 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALS2CLQ60I27 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms