Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USPL1Q5W0Q7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USPL1Q5W0Q7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms