Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHEQ5VZ18 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms