Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUSD4Q5VX71 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUSD4Q5VX71 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms