Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GARNL3Q5VVW2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms