Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HDGFL1Q5TGJ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms