Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CC2D1BQ5T0F9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms