Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PHYHD1Q5SRE7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms