Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAT1Q5SQI0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms