Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FRMPD3Q5JV73 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FRMPD3Q5JV73 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms