Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FGD3Q5JSP0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FGD3Q5JSP0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms