Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PITRM1Q5JRX3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms