Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ODF2Q5BJF6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ODF2Q5BJF6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms