Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ALFQ53S48 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms