Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ANKRD39Q53RE8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms