Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TMEM259Q4ZIN3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TMEM259Q4ZIN3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms