Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP13A4Q4VNC1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms