Protein–RNA interactions for Protein: Q495D7

LINC01559, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01559, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01559Q495D7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01559Q495D7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LINC01559Q495D7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms