Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC25A52Q3SY17 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC25A52Q3SY17 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms