Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSGA10IPQ3SY00 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSGA10IPQ3SY00 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms