Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SKIDA1Q1XH10 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SKIDA1Q1XH10 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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