Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL24A1Q17RW2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL24A1Q17RW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
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