Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CLPPQ16740 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLPPQ16740 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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