Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF239Q16600 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF239Q16600 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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