Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNAPC1Q16533 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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