Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDB1Q16531 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
DDB1Q16531 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms