Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABRA6Q16445 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GABRA6Q16445 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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