Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NTRK3Q16288 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms