Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNGA3Q16281 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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