Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC6Q16204 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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