Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
ZNF56Q15929 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ZNF56Q15929 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms