Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VPS72Q15906 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VPS72Q15906 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
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