Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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VAMP3Q15836 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VAMP3Q15836 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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