Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RAB35Q15286 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB35Q15286 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms