Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BRD3Q15059 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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BRD3Q15059 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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BRD3Q15059 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
BRD3Q15059 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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