Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPNMBQ14956 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GPNMBQ14956 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPNMBQ14956 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPNMBQ14956 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
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