Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SCARB2Q14108 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCARB2Q14108 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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