Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RASGRF1Q13972 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RASGRF1Q13972 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms