Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP1A4Q13733 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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