Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KRR1Q13601 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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