Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCIRG1Q13488 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCIRG1Q13488 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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