Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MSLNQ13421 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MSLNQ13421 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms