Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NME3Q13232 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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