Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MRPL28Q13084 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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