Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSTF3Q12996 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSTF3Q12996 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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