Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFX1Q12986 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFX1Q12986 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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