Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPN13Q12923 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPN13Q12923 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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